El Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina a barca una extensión de 350.000 km ² de aguas territoriales colombianas y zona económica exclusiva en el Caribe Occidental. De esta extensión solo unos 70 km ² corresponden la porción terrestre y 2.000 km ² a aguas neríticas sobre la plataforma de islas y cayos, lo demás son aguas oceánicas.

El Archipiélago esta ubicado en la zona intertropical. El clima es cálido-húmedo y está influenciado tanto por la localización de la Isla y sus características fisiográficas como por la acción de los vientos alisios, que determinan un régimen monomodal de precipitaciones con período seco entre enero y mayo y uno húmedo entre junio y diciembre.

La Isla de San Andrés y Providencia difieren en su naturaleza geológica, siendo la primera de origen coralino y la segunda volcánica, con alguna influencia coralina en el litoral; están asentadas en plataformas independientes entre sí y de la plataforma continental.

Las plataformas submarinas de islas, cayos y bajos están ocupadas por complejos arrecifales coralinos de gran belleza, que incluyen arrecifes de barrera en San Andrés, Providencia y Quitasueño, atolones en algunos de los cayos, extensas praderas de fanerógamas marinas y vastos fondos de arena y fragmentos coralinos, además de pequeños manglares, playas de arena y rocas litorales. El grado de desarrollo de las formaciones coralinas del Archipiélago es el mayor de Colombia.